Геномные характеристики российских пациентов с немелкоклеточным раком легкого: результаты тестирования методом секвенирования нового поколения

Введение. Секвенирование нового поколения (NGS) – это молекулярный подход, способный обеспечить клинициста комплексной информацией о молекулярном профиле пациента, что является важной частью эффективного применения таргетной терапии.

Цель. Оценить частоту встречаемости опухолевых соматических мутаций при немелкоклеточном раке легкого (НМРЛ) в выборке российских пациентов с НМРЛ для последующей оптимизации диагностики и персонализации тактики лечения.

Материалы и методы. В исследование вошли результаты тестирования методом NGS когорты из 1 400 пациентов с НМРЛ в период с 17.03.2023 по 22.07.2024. В реализации многоцентрового исследования приняли участие ряд других клиник страны. Использовались панели с различными вариантами определения возможных генетических нарушений. Проведен анализ частоты встречаемости различных нарушений в зависимости от панели, клинических характеристик пациентов с учетом географического и этнографического разнообразия регионов страны.

Результаты. Наиболее часто мутации обнаруживались в генах KRAS (17,9%), EGFR (15,8%) и среди никогда не куривших женщин. Частота выявленных редких мутаций, таких как RET, MET и NTRK, соответствует литературным данным и свидетельствует в пользу необходимости расширения группы пациентов, тестируемых на данные нарушения. Но и среди курильщиков встречались делеция 19-го экзона EGFR (12,7%) и KRAS G12C (16,4%). Полученные результаты подчеркивают недостаточный объем существующего объема тестирования, в т. ч. из-за отсутствия определения ко-мутаций и первично-резистентных мутаций, но в то же время демонстрируют возможные различия при использовании различных диагностических панелей.

Выводы. Внедрение NGS в систему общественного здравоохранения позволяет более персонифицировано подойти к выбору тактики лечения пациентов. Полученные данные могут быть использованы в предсказательных моделях по оптимизации распределения лекарственных препаратов.

1. Mosele MF, Westphalen CB, Stenzinger A, Barlesi F, Bayle A, Bièche I et al. Recommendations for the use of next-generation sequencing (NGS) for patients with advanced cancer in 2024: a report from the ESMO Precision Medicine Working Group. Ann Oncol. 2024;35(7):588-606. https://doi.org/10.1016/j.annonc.2024.04.005.

2. van de Haar J, Roepman P, Andre F, Balmaña J, Castro E, Chakravarty D et al. ESMO Recommendations on clinical reporting of genomic test results for solid cancers. Ann Oncol. 2024;35(11):954-967. https://doi.org/10.1016/j.annonc.2024.06.018.

3. Penault-Llorca F, Kerr KM, Garrido P, Thunnissen E, Dequeker E, Normanno N et al. Expert Opinion on NSCLC Small Specimen Biomarker Testing-Part 2: Analysis, Reporting, and Quality Assessment. Virchows Arch. 2022;481:351-366. https://doi.org/10.1007/s00428-022-03344-1.

4. Хатьков ИЕ, Жукова ЛГ, Данишевич АМ, Бодунова НА, Воронцова МВ, Макарова МВ и др. Рекомендации по медицинскому сопровождению пациентов с верифицированными (подтвержденными) наследственными опухолевыми синдромами и их родственников с выявленной предрасположенностью к развитию онкологических заболеваний. М.: ООО «Эвоген», ГБУЗ «МКНЦ им. А.С. Логинова ДЗМ»; 2022. 27 с. Режим доступа: https://mosgenetics.ru/рекомендации-по-медицинскому-сопров-2/.

5. Лактионов КК, Артамонова ЕВ, Бредер ВВ, Горбунова ВА, Демидова ИА, Деньгина НВ и др. Немелкоклеточный рак легкого. Злокачественные опухоли. 2023;13(3s2):42-65. https://doi.org/10.18027/2224-5057-2023-13-3s2-1-42-65.

6. Лактионов КК, Артамонова ЕВ, Бредер ВВ, Борисова ТН, Бычков МБ, Владимирова ЛЮ и др. Злокачественное новообразование бронхов и легкого: клинические рекомендации. 2021. Режим доступа: https://cr.minzdrav.gov.ru/recomend/30_3.

7. Pisapia P, Pepe F, Baggi A, Barberis M, Galvano A, Gristina V et al. Next generation diagnostic algorithm in non-small cell lung cancer predictive molecular pathology: The KWAY Italian multicenter cost evaluation study. Crit Rev Oncol Hematol. 2022;169:103525. https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2021.103525.

8. Chakravarty D, Johnson A, Sklar J, Lindeman NI, Moore K, Ganesan S et al. Somatic Genomic Testing in Patients With Metastatic or Advanced Cancer: ASCO Provisional Clinical Opinion. J Clin Oncol. 2022;40(11):1231-1258. https://doi.org/10.1200/jco.21.02767.

9. Ettinger DS, Wood DE, Aisner DL, Akerley W, Bauman JR, Bharat A et al. NCCN Guidelines® Insights: Non-Small Cell Lung Cancer, Version 2.2023. J Natl Compr Canc Netw. 2023;21(4):340-350. https://doi.org/10.6004/jnccn.2023.0020.

10. Riely GJ, Wood DE, Ettinger DS, Aisner DL, Akerley W, Bauman JR et al. NonSmall Cell Lung Cancer, Version 4.2024, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology. J Natl Compr Canc Netw. 2024;22(4):249-274. https://doi.org/10.6004/jnccn.2204.0023.

11. Lindeman NI, Cagle PT, Aisner DL, Arcila ME, Beasley MB, Bernicker EH et al. Updated Molecular Testing Guideline for the Selection of Lung Cancer Patients for Treatment With Targeted Tyrosine Kinase Inhibitors: Guideline From the College of American Pathologists, the International Association for the Study of Lung Cancer, and the Association for Molecular Pathology. J Thorac Oncol. 2018;13(3):323-358. https://doi.org/10.1016/j.jtho.2017.12.001.

12. Hendriks LE, Kerr KM, Menis J, Mok TS, Nestle U, Passaro A et al. Oncogeneaddicted metastatic non-small-cell lung cancer: ESMO Clinical Practice Guideline for diagnosis, treatment and follow-up. Ann Oncol. 2023;34(4):339-357. https://doi.org/10.1016/j.annonc.2022.12.009.

13. Remon J, Soria JC, Peters S. Early and locally advanced non-small-cell lung cancer: an update of the ESMO Clinical Practice Guidelines focusing on diagnosis, staging, systemic and local therapy. Ann Oncol. 2021;32(12):1637-1642. https://doi.org/10.1016/j.annonc.2021.08.1994.

14. Mateo J, Chakravarty D, Dienstmann R, Jezdic S, Gonzalez-Perez A, Lopez-Bigas N et al. A framework to rank genomic alterations as targets for cancer precision medicine: the ESMO Scale for Clinical Actionability of molecular Targets (ESCAT). Ann Oncol. 2018;29(9):1895-1902. https://doi.org/10.1093/annonc/mdy263.

15. Herbst RS, Wu YL, John T, Grohe C, Majem M, Wang J et al. Adjuvant Osimertinib for Resected EGFR-Mutated Stage IB-IIIA Non-Small-Cell Lung Cancer: Updated Results From the Phase III Randomized ADAURA Trial. J Clin Oncol. 2023;41(10):1830-1840. https://doi.org/10.1200/jco.22.02186.

16. Jabbour SK, Lee KH, Frost N, Breder V, Kowalski DM, Pollock T et al. embrolizumab Plus Concurrent Chemoradiation Therapy in Patients With Unresectable, Locally Advanced, Stage III Non-Small Cell Lung Cancer: The Phase 2 KEYNOTE-799 Nonrandomized Trial. JAMA Oncol. 2021;7(9):1-9. https://doi.org/10.1001/jamaoncol.2021.2301.

17. Iyer RS, Needham SR, Galdadas I, Davis BM, Roberts SK, Man RCH et al. Drug-resistant EGFR mutations promote lung cancer by stabilizing interfaces in ligand-free kinase-active EGFR oligomers. Nat Commun. 2024;15(1):2130. https://doi.org/10.1038/s41467-024-46284-x.

18. Goulding RE, Chenoweth M, Carter GC, Boye ME, Sheffield KM, John WJ et al. KRAS mutation as a prognostic factor and predictive factor in advanced/metastatic non-small cell lung cancer: A systematic literature review and meta-analysis. Cancer Treat Res Commun. 2020;24:100200. https://doi.org/10.1016/j.ctarc.2020.100200.

19. Liang Y, Maeda O, Kondo C, Nishida K, Ando Y. Effects of KRAS, STK11, KEAP1, and TP53 mutations on the clinical outcomes of immune checkpoint inhibitors among patients with lung adenocarcinoma. PLoS ONE. 2024;19(7):e0307580. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0307580.

20. Seminati D, L’Imperio V, Casati G, Ceku J, Pilla D, Scalia CR et al. Economic assessment of NGS testing workflow for NSCLC in a healthcare setting. Heliyon. 2024;10(7):e29272. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e29272.

21. Provencio M, Carcereny E, Rodríguez-Abreu D, López-Castro R, Guirado M, Camps C et al. Lung cancer in Spain: information from the Thoracic Tumors Registry (TTR study). Transl Lung Cancer Res. 2019;8(4):461-475. https://doi.org/10.21037/tlcr.2019.08.05.

22. Barlesi F, Mazieres J, Merlio JP, Debieuvre D, Mosser J, Lena H et al. Routine molecular profiling of patients with advanced non-small-cell lung cancer: results of a 1-year nationwide programme of the French Cooperative Thoracic Intergroup (IFCT). Lancet. 2016;387(10026):1415-1426. https://doi.org/10.1016/s0140-6736(16)00004-0.

23. Tsoulos N, Papadopoulou E, Metaxa-Mariatou V, Tsaousis G, Efstathiadou C, Tounta G et al. Tumor molecular profiling of NSCLC patients using next generation sequencing. Oncol Rep. 2017;38(6):3419-3429. https://doi.org/10.3892/or.2017.6051.

24. Simarro J, Pérez-Simó G, Mancheño N, Ansotegui E, Muñoz-Núñez CF, Gómez-Codina J et al. Impact of Molecular Testing Using Next-Generation Sequencing in the Clinical Management of Patients with Non-Small Cell Lung Cancer in a Public Healthcare Hospital. Cancers. 2023;15(6):1705. https://doi.org/10.3390/cancers15061705.

25. Zhang YL, Yuan JQ, Wang KF, Fu XH, Han XR, Threapleton D et al. The prevalence of EGFR mutation in patients with non-small cell lung cancer: a systematic review and meta-analysis. Oncotarget. 2016;7(48):78985-78993. https://doi.org/10.18632/oncotarget.12587.

26. Fan L, Feng Y, Wan H, Shi G, Niu W. Clinicopathological and Demographical Characteristics of Non-Small Cell Lung Cancer Patients with ALK Rearrangements: A Systematic Review and Meta-Analysis. PLoS ONE. 2014;9:e100866. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0100866.

27. Vasudevan S, Krishna V, Mehta A. Lung Cancer in Non-Smokers: Clinicopathological and Survival Differences from Smokers. Cureus. 2022;14(12):e32417. https://doi.org/10.7759/cureus.32417.

28. Lim SM, Kim EY, Kim HR, Ali SM, Greenbowe JR, Shim HS et al. Genomic profiling of lung adenocarcinoma patients reveals therapeutic targets and confers clinical benefit when standard molecular testing is negative. Oncotarget. 2016;7(17):24172-24178. https://doi.org/10.18632/oncotarget.8138.

29. Wang Y, Liu H, Yu N, Xiang X. Concordance of Abundance for Mutational EGFR and Co-Mutational TP53 with Efficacy of EGFR-TKI Treatment in Metastatic Patients with Non-Small-Cell Lung Cancer. Curr Oncol. 2023;30(9):8464-8476. https://doi.org/10.3390/curroncol30090616.

30. Tu T, Chen D, Jiang H, Ma J, Wang H, Chen C. The Prognosis of Advanced NonSmall Cell Lung Cancer Patients with Precision-Targeted Therapy Guided by NGS Testing or Routine Testing. Cancer Manag Res. 2023;15:1307-1318. https://doi.org/10.2147/cmar.s436808.